palmettobug
Contents:
Welcome to PalmettoBUG!
Launching PalmettoBUG
Image Processing
Single-Cell Analysis
Spatial Analysis
Making a Pixel Classifier
Using a Pixel Classifier
Understanding the PalmettoBUG Interface
Advanced PalmettoBUG and its Directory Structure
Bead Normalization Option
Glossary
FAQ / Common Errors
Citing & Acknowledgements
Tutorials (outside GUI):
Tutorial Notebooks
API:
API Reference
palmettobug
Submodules
palmettobug.Analysis_functions
palmettobug.Entrypoint
palmettobug.Executable
palmettobug.ImageProcessing
palmettobug.Pixel_Classification
palmettobug.Utils
Classes
Functions
Package Contents
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API Reference
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palmettobug.Utils
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Submodules
palmettobug.Utils.sharedClasses